Paprastosios sekos

Tai yra labai dažnos kartotinės sekos, jas sudaro 5–500 bazių porų. Žinduolių genomas turi apie milijoną tokių sekų kopijų. Jos eina viena paskui kitą (tandemas) ir sudaro sankaupas (klasterius). Šios sekos sudaro blokus, kurių kiekvienas turi daugybę labai dažnai pasikartojančių sekų kopijų. Tam tikrais atvejais šios kopijos yra tapačios, kitais atvejais jų struktūros yra panašios. Dėl trumpumo tokios sekos dar vadinamos paprastosiomis sekomis (angl. simple sequence). Nurašymo (transkripcijos) požiūriu šios sekos neaktyvios, manoma, kad jos dalyvauja, sudarant kompaktišką chromatino struktūrą. Tam tikros paprastosios sekos įeina į nurašymo (transkripcijos) vienetų (genų) sudėtį, pvz., neperduodamos (netransliuojamos) mRNR šoninės sekos arba intronai, kurie pašalinami mRNR brendimo metu. Kitos gali atlikti signalinių sekų, kurias atpažįsta baltymai, funkciją. Joms priklauso nurašymo (transkripcijos) promotoriai (pradmenys), replikacijos pradžios vietos, chromosomų sąveikos metu susidarančių kilpų vietos, kinetochorų tvirtinimosi vietos ir kiti elementai, būtini ląstelės funkcijai. Kalbant apie virusų genomą, yra duomenų, kad šios sekos svarbios atpažįstant replikacijos pradžią. Paprastos sekos sudaro palydovinę DNR, kuri gali būti metilinta.

Šaltinis | Dažniausiai vartojamų biomedicinos terminų ir sąvokų aiškinamasis žinynas | Lietuvos sveikatos mokslų universitetas | Akademikas Profesorius Antanas Praškevičius, Profesorė Laima Ivanovienė